1. 契税：按照房屋交易价格的1.5%征收，其中对于90平方米以下的房屋，首次购买的按照1%的税率征收。
2. 个人所得税：对于购买的二套房，如果房屋属于家庭唯一住房，且购买时间不满2年，需要缴纳1%的个人所得税；如果购买时间超过2年，则免征个人所得税。如果房屋属于家庭非唯一住房，或者购买时间不满2年，需要缴纳1%的个人所得税；如果购买时间超过2年，则按照差额的20%征收个人所得税。
3. 营业税：对于购买的二套房，如果房屋属于家庭唯一住房，且购买时间不满2年，需要缴纳5.6%的营业税；如果购买时间超过2年，则免征营业税。如果房屋属于家庭非唯一住房，或者购买时间不满2年，需要缴纳5.6%的营业税；如果购买时间超过2年，则按照差额的5.6%征收营业税。
5. 印花税：对于购买的二套房，需要缴纳0.05%的印花税。
了解了南京二套房的税费情况，我们再来看看购房者所关心的利率问题。在南京，二套房的利率相较于首套房会有所上浮。根据我国最新的房贷政策，二套房的贷款利率以基准利率为基础，上浮10%。以2021年为例，南京二套房的贷款利率在基准利率的基础上上浮10%，即5.39%的利率。需要注意的是，不同银行的具体执行利率可能会有所差异，购房者应在购房前向银行咨询清楚。
综上所述，在南京购买二套房需要缴纳的税费以及所面临的利率问题相当复杂，购房者需要充分了解相关政策，以便做出明智的投资决策。在实际操作中，购房者可以结合自身实际情况，合理规划购房预算，充分利用政策优惠，降低购房成本。同时，购房者在选择银行时，可以对比不同银行的政策和利率，选择最适合自己的贷款产品。
最后，祝愿所有购房者都能在南京这座美丽的城市中，找到心仪的房子，实现美好的居住梦想。